Berdasar paparan data, temuan dan analisis hasil penelitian dapat ditarik sejumlah kesimpulan tentang peristiwa kerusuhan 10 Oktober 1996 di Situbondo sebagai berikut:

1. Aspek Sosio-antropologis

• Ditinjau dari aspek sosio-antropologis, masyarakat Situbondo adalah komunitas yang memiliki identitas kultural yang khas. Mereka memiliki kebanggaan dengan identitas itu. Baik warga pribumi maupun warga keturunan Cina dan Arab, memiliki kebanggaan dengan identitas ke-situbondo-an mereka baik dari segi kebahasaan, tata pergaulan, hubungan patron-klien, bahkan keagamaan. Singkatnya, komunitas Situbondo seumumnya menghendaki identitas diri mereka sebagai komunitas yang khas Situbondo yang di masa silam diberi sebutan kehormatan "Wirabhumi" yakni tanah para ksatria perkasa.
 
• Kebanggaan identitas ke-situbondo-an itu oleh mayoritas penduduknya kemudian diwujudkan dalam bentuk semboyan "SANTRI" yang memiliki konotasi ke-Islam-an kuat. Penduduk pribumi Situbondo -- bagaimana pun tidak taatnya dalam beragama -- umumnya bangga disebut santri. Dengan demikian, istilah "santri" bagi masyarakat Situbondo memiliki makna tersendiri yang hanya bisa mereka fahami sendiri. Dan mereka, umumnya menghendaki agar orang di luar mereka menghargai dan menghormati identitas itu.
 
• Sebagai akibat adanya kesamaan dalam perasaan bangga dengan ke-situbondo-an yang dimiliki, maka secara tradisional hubungan komunitas mayoritas yang muslim dengan komunitas minoritas yang non-muslim dapat terjalin dergan baik. Komunitas non-muslim yang umumnya keturunan Cina, seperti seumumnya warga muslim, juga sangat menghormati dan memuliakan figur kiai. Seringkali dengan melepas identitas keagamaannya, masyarakat non-muslim keturunan Cina meminta bantuan kepada kiai terutama tentang hal-hal yang bersifat spiritual.
 
• Bertolak dari kesamaan visi tentang ke-situbondo-an yang mereka banggakan hubungan patron-klien yang terbentuk di kawasan itu menjadi unik. Sebab figur kiai yang di daerah lain dijadikan panutan oleh komunitas santri, di Situbondo figur kiai justru dijadikan pula panutan oleh komunitas keturunan Cina yang bukan pemeluk Islam. Pola hubungan patron-klien ini setidaknya sudah terbentuk sejak jaman kolonial Belanda.
 
• Keselarasan hubungan antara komunitas mayoritas dangan komunitas minoritas yang terbina sejak jaman kolonial Belanda dengan figur kiai sebagai dinamisator dan stabilisator, setidaknya terbukti dari bermunculannya bangunan-bangunan gereja Katholik dan Kristen di berbagai daerah di Situbondo. Gereja-gereja raksasa yang dibangun oleh minoritas Kristen bertumbuhan bagaikan jamur di jalan-jalan protokol. Namun demikian komunitas kiai santri tidak memasalahkan sebagaimana hal itu terjadi di daerah-daerah lain.
 
• Memasuki tahun 1996, komunitas mayoritas di Situbondo, mendadak memasalahkan keberadaan gereja-gereja di berbagai jalan protokol di Situbondo (data terakhir yang diterima TPF GP Ansor menyebut, masalah keberadaan gereja ramai dibicarakan umat Islam Situbondo setelah kunjungan rombongan MUI Pusat ke Situbondo. Dalam kunjungan itu, Ketua MUI menyinggung soal gereja Bukit Sion yang berdiri tegak di pintu barat kota. Sejak saat itu, komunitas mayoritas mulai hangat membicarakan keberadaan gereja gereja tersebut). Komunitas mayoritas yang bangga dengan identitas "santri" mendadak bagaikan "ditampar" oleh fakta yang terpampang di depan matanya. Mereka merasa dipermalukan dengan fakta yang mereka anggap mencemari identitas ke-santri-an mereka.
 
• Sebagai komunitas yang terbentuk dalam struktur patron klien, komunitas mayoritas Situbondo kemudian mengkonsultasikan masalah yang "memalukan" mereka itu kepada para patron mereka yakni kiai-kiai berpengaruh seperti KH Achmad Sofyan, KH Kholil As'ad dan KH Fawaid As’ad. Dalam konteks ini, para kiai dihadapkan pada suatu dilema yakni komunitas minoritas yang dilaporkan oleh komunitas mayoritas itu sebagian besar adalah pengikutnya (klien). Masalah itu kemudian terkesan "mengambang" karena belum diketemukan jalan keluar yang baik.
 
• Dalam kondisi semacam di atas, tiba-tiba muncul kerusuhan yang dimulai di kompleks PN Situbondo dan gereja Bukit Sion yang dilakukan oleh orang-orang tak dikenal ditambah para pengikut KH Zaini. Komunitas mayoritas yang masalahnya "mengambang" dengan cepat terpancing oleh gerakan kerusuhan yang menggunakan slogan-slogan khas seperti: Hidup NU! Hidup PPP! Allahu Ahbar! Mereka kemudian ikut terjun ke dalam arus kerusuhan. Ikut terlibatnya warga Situbondo dalam kerusuhan 10 Oktober 1996, dapat dilihat sebagai suatu disharmoni dalam dinamika sosial. Karena hal tersebut telah memecah harmonisasi antar klien yang sudah terbina baik selama itu.